Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ComtO88587 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ComtO88587 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ComtO88587 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ComtO88587 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ComtO88587 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ComtO88587 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ComtO88587 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ComtO88587 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ComtO88587 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ComtO88587 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ComtO88587 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ComtO88587 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ComtO88587 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ComtO88587 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ComtO88587 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ComtO88587 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ComtO88587 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ComtO88587 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ComtO88587 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ComtO88587 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ComtO88587 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ComtO88587 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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ComtO88587 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
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ComtO88587 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ComtO88587 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ComtO88587 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ComtO88587 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ComtO88587 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ComtO88587 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ComtO88587 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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ComtO88587 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ComtO88587 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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ComtO88587 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ComtO88587 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ComtO88587 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ComtO88587 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ComtO88587 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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ComtO88587 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ComtO88587 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ComtO88587 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ComtO88587 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ComtO88587 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ComtO88587 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ComtO88587 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ComtO88587 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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ComtO88587 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ComtO88587 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ComtO88587 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ComtO88587 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ComtO88587 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ComtO88587 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ComtO88587 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ComtO88587 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ComtO88587 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ComtO88587 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ComtO88587 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ComtO88587 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ComtO88587 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ComtO88587 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ComtO88587 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ComtO88587 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms