Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnal1O88327 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnal1O88327 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnal1O88327 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms