Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stra6O70491 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stra6O70491 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stra6O70491 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stra6O70491 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stra6O70491 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms