Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35aO55142 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl35aO55142 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms