Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap2O55126 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap2O55126 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap2O55126 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms