Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn20O55082 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptpn20O55082 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptpn20O55082 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms