Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trdmt1O55055 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trdmt1O55055 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms