Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb2O55029 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Copb2O55029 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb2O55029 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Copb2O55029 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb2O55029 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb2O55029 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb2O55029 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb2O55029 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copb2O55029 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copb2O55029 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb2O55029 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb2O55029 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms