Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn5O54942 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn5O54942 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn5O54942 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn5O54942 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn5O54942 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cldn5O54942 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn5O54942 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn5O54942 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn5O54942 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn5O54942 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn5O54942 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn5O54942 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms