Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3O54890 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb3O54890 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms