Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TsksO54887 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TsksO54887 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TsksO54887 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TsksO54887 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TsksO54887 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TsksO54887 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TsksO54887 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TsksO54887 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TsksO54887 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TsksO54887 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TsksO54887 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TsksO54887 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TsksO54887 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TsksO54887 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TsksO54887 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TsksO54887 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TsksO54887 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TsksO54887 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TsksO54887 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TsksO54887 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TsksO54887 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TsksO54887 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TsksO54887 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TsksO54887 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TsksO54887 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TsksO54887 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TsksO54887 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TsksO54887 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TsksO54887 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TsksO54887 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TsksO54887 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TsksO54887 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TsksO54887 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TsksO54887 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TsksO54887 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TsksO54887 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TsksO54887 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TsksO54887 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TsksO54887 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TsksO54887 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TsksO54887 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TsksO54887 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TsksO54887 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TsksO54887 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TsksO54887 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TsksO54887 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TsksO54887 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TsksO54887 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TsksO54887 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TsksO54887 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TsksO54887 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TsksO54887 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TsksO54887 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TsksO54887 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TsksO54887 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TsksO54887 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TsksO54887 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TsksO54887 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TsksO54887 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TsksO54887 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TsksO54887 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TsksO54887 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TsksO54887 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TsksO54887 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TsksO54887 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TsksO54887 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TsksO54887 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TsksO54887 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TsksO54887 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms