Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxO54751 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxO54751 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxO54751 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrxO54751 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrxO54751 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CrxO54751 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CrxO54751 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxO54751 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CrxO54751 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CrxO54751 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CrxO54751 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CrxO54751 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CrxO54751 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CrxO54751 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CrxO54751 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CrxO54751 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CrxO54751 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CrxO54751 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CrxO54751 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CrxO54751 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CrxO54751 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CrxO54751 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CrxO54751 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CrxO54751 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CrxO54751 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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