Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp15O54732 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp15O54732 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.7 ms