Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Per1O35973 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Per1O35973 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Per1O35973 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Per1O35973 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Per1O35973 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Per1O35973 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Per1O35973 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Per1O35973 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Per1O35973 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Per1O35973 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Per1O35973 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Per1O35973 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Per1O35973 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Per1O35973 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Per1O35973 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Per1O35973 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Per1O35973 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Per1O35973 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Per1O35973 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Per1O35973 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Per1O35973 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Per1O35973 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Per1O35973 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Per1O35973 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Per1O35973 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Per1O35973 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Per1O35973 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Per1O35973 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Per1O35973 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Per1O35973 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Per1O35973 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Per1O35973 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Per1O35973 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Per1O35973 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Per1O35973 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Per1O35973 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Per1O35973 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Per1O35973 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Per1O35973 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Per1O35973 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Per1O35973 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Per1O35973 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Per1O35973 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Per1O35973 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Per1O35973 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Per1O35973 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Per1O35973 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Per1O35973 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Per1O35973 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Per1O35973 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Per1O35973 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Per1O35973 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Per1O35973 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Per1O35973 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Per1O35973 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Per1O35973 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Per1O35973 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Per1O35973 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms