Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek2O35942 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek2O35942 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek2O35942 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek2O35942 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek2O35942 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek2O35942 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms