Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf9O35739 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf9O35739 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf9O35739 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf9O35739 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf9O35739 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf9O35739 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf9O35739 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms