Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfibp2O35711 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfibp2O35711 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp2O35711 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfibp2O35711 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms