Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrcpO35427 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CrcpO35427 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrcpO35427 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrcpO35427 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CrcpO35427 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrcpO35427 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrcpO35427 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms