Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pkd2O35245 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Pkd2O35245 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pkd2O35245 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms