Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf11O35235 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf11O35235 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms