Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx3O35160 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx3O35160 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms