Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn4O35054 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn4O35054 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn4O35054 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms