Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyth3O08967 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyth3O08967 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms