Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tcof1O08784 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcof1O08784 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcof1O08784 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms