Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tcrg-C3L7N479 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tcrg-C3L7N479 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tcrg-C3L7N479 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tcrg-C3L7N479 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tcrg-C3L7N479 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tcrg-C3L7N479 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tcrg-C3L7N479 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tcrg-C3L7N479 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tcrg-C3L7N479 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tcrg-C3L7N479 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tcrg-C3L7N479 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tcrg-C3L7N479 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tcrg-C3L7N479 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tcrg-C3L7N479 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tcrg-C3L7N479 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tcrg-C3L7N479 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tcrg-C3L7N479 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Tcrg-C3L7N479 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tcrg-C3L7N479 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tcrg-C3L7N479 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tcrg-C3L7N479 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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