Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5108J3QP01 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5108J3QP01 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms