Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c2J3QNM1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms