Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21411J3KMS0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21411J3KMS0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms