Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf4bG5E8Z2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf4bG5E8Z2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms