Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lcG5E8I7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp17lcG5E8I7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp17lcG5E8I7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp17lcG5E8I7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp17lcG5E8I7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms