Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r34G3XA52 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r34G3XA52 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r34G3XA52 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r34G3XA52 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r34G3XA52 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r34G3XA52 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r34G3XA52 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r34G3XA52 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms