Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf148G3X9R7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms