Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna9G3X8Z7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chrna9G3X8Z7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms