Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pira2F8VQ94 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pira2F8VQ94 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms