Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp32F8VPZ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp32F8VPZ3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp32F8VPZ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms