Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh11xF6ZNL5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms