Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sptbn5F6UCX4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptbn5F6UCX4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptbn5F6UCX4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms