Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syngap1F6SEU4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syngap1F6SEU4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syngap1F6SEU4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms