Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prl3d2F6R3P9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prl3d2F6R3P9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prl3d2F6R3P9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms