Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pik3c2bE9QAN8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pik3c2bE9QAN8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms