Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trip11E9Q512 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trip11E9Q512 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip11E9Q512 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms