Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms