Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ApobE9Q414 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ApobE9Q414 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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