Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms