Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Fndc1E9Q043 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Fndc1E9Q043 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms