Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ryr1E9PZQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ryr1E9PZQ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.9 ms