Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Scaf11E9PZM7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Scaf11E9PZM7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms