Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srp54bE9PXC0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Srp54bE9PXC0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srp54bE9PXC0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms