Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gimd1E9PW74 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gimd1E9PW74 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gimd1E9PW74 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gimd1E9PW74 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gimd1E9PW74 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms