Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl3E0CZ16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl3E0CZ16 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl3E0CZ16 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms